Režim mikrobubliniek sa zameriava na dôkladné a hĺbkové čistenie. Počas tohto režimu sa vytvárajú mikroskopické bublinky vody alebo prúdu vzduchu, ktoré prenikajú do medzizubných priestorov a ťažko dostupných oblastí. Tieto bublinky pomáhajú odstrániť aj tie najmenšie zvyšky jedla a baktérie, čo vedie k dôkladnému vyčisteniu zubov a celkovému zlepšeniu ústnej hygieny.